El Proyecto Águila Coronada es una línea de trabajo que se gesta en el marco del PCRAR. Focaliza sus acciones de trabajo en el Águila Coronada (Buteogallus coronatus). Esta especie fue recategorizada en 2003, pasando a ser una de las águilas mas amenazadas de Sudamérica, se encuentra en peligro de extinción a nivel nacional e internacional.

Desde la Fundación Caburé-í trabajamos en su conservación, realizando los rescates a nivel nacional para la especie, rehabilitándolas y realizando sus liberaciones en las provincias donde fueron encontradas. También contribuimos estudiando su biología básica y registrando sus comportamientos en temporada reproductiva. Junto a otras instituciones conservacionistas, creamos el Plan de Acción para la Conservación de la especie en la Argentina y lo mantenemos actualizado, realizando trabajos de gestión organizativa y funcionamiento operativo.